ChordEngine

 
ChordEngine = class ChordEngine(Engine)
    ChordEngine(walkers, errdis, copy=None, **kwargs)
 
Move a a walker in a random direction.
 
The ChordEngine draws a random line through the walker parameters in
unit space, from unitMin (lowpoint) with lengths unitRange (highpoint).
 
A random point on the line is selected. If the corresponding parameter
set has a likelihood < LowLhood, it is accepted. Otherwise either the
highpoint is reset to the random point (if randompoint > walkerpoint)
or the lowpoint is replaced by the randompoint (if walker < random).
Then a new random point on the line is selected, until the point is accepted.
 
When the point is accepted, another random line is constructed
through the new point and orthogonal to (all) previous ones.
(The orthogonality is not implemented now. TBC).
 
This is an independent implementation inspired by the polychord engine
described in:
"POLYCHORD: next-generation nested sampling",
WJ Handley, MP Hobson and AN Lasenby.
MNRAS (2015) Volume 453, Issue 4, p 4384–4398
 
Attributes
----------
nstep : int
    average number of orthogonal steps
debug : bool
    perform the step-out action too
 
Attributes from Engine
----------------------
walkers, errdis, slow, maxtrials, rng,
         verbose, report, unitRange, unitMin

 
Author       Do Kester.
 
 
Method resolution order:
ChordEngine
Engine
builtins.object

Constructor:
ChordEngine( walkers, errdis, copy=None, **kwargs )
Constructor.
 
Parameters
----------
walkers : WalkerList
    walkers to be diffused
errdis : ErrorDistribution
    error distribution to be used
copy : ChordEngine
    to be copied
kwargs : for Engine
    "slow", "seed", "verbose"
Methods defined here:
copy()
Return copy of this.
execute( kw, lowLhood, append=False, iteration=0)
Execute the engine by diffusing the parameters.
 
Parameters
----------
kw : int
    index of walker to diffuse
lowLhood : float
    lower limit in logLikelihood
append : bool
    set walker in place or append
iteration : int
    iteration number
 
Returns
-------
int : the number of successfull moves
stepOut( problem, ptry, usav, vel, t,
         tmax, lowLhood, fitIndex)

Check if endpoints are indeed outside the lowLhood domain.

Methods inherited from Engine: