WalkerList

 
WalkerList = class WalkerList(builtins.list)
    WalkerList(problem, nwalkers, allpars, fitIndex)
 
WalkerList is a list of Walker.
 
It is the working ensemble of NestedSampler.
 
 
Attributes
----------
logZ : float (read-only)
    Natural log of evidence
info : float (read-only)
    The information H. The compression factor ( the ratio of the prior space
    available to the model parameters over the posterior space ) is equal to the exp( H ).
iteration : int
    Present iteration number.
 
Author       Do Kester
 
 
Method resolution order:
WalkerList
builtins.list
builtins.object
Constructor:
WalkerList( problem, nwalkers, allpars, fitIndex )
Constructor.
 
Parameters
----------
nwalkers : int
    number of walkerss created.
problem : Problem
    to be used in the walkerss
allpars : array_like
    parameters and hyperparams of the problem
fitIndex : array_like
    indices of allpars to be fitted
Methods defined here:
addWalkers( problem, nWalkers, allpars, fitIndex )
copy( src, des )
Copy one item of the list onto another.
 
Parameters
----------
src : int
    the source item
des : int
    the destination item
getLogLikelihoodEvolution()
Return the evolution of the log( Likelihood ).
getLowLogL()
Return the lowest value of logL in the walkerlist, plus its index.
getParameterEvolution( kpar=None )
Return the evolution of one or all parameters.
 
In case of dynamic models the number of parameters may vary.
They are zero-padded. Use `getNumberOfParametersEvolution`
to get the actual number.
 
Parameters
----------
kpar : int or tuple of ints
    the parameter to be selected. Default: all
getScaleEvolution()
Return the evolution of the scale.
logPlus( x, y )
Return the log of sum.
setWalker( walker, index )
replace/append a Walker to this list
 
Parameters
----------
walker : Walker
    the list to take to copy from
index : int
    the index at which to set
Methods inherited from builtins.list:
Overloaded operators and aliases
Other methods Overloaded operators and aliases